在开发Java Web应用程序时，Eclipse是一个非常受欢迎的集成开发环境（IDE），当使用Eclipse运行JSP（Java Server Pages）时，有时会遇到服务器启动失败或运行错误的情况，以下是一些常见的问题及其解决方法。

一、服务器无法启动

1、端口冲突：如果Tomcat服务器无法启动，提示端口被占用，可能是由于该端口正在被其他程序使用，默认情况下，Tomcat使用8080端口，可以通过以下步骤修改端口号：

- 打开Eclipse，选择“Servers”视图，双击Tomcat服务器。

- 在弹出的对话框中，点击“Ports”标签，修改“HTTP/1.1”端口为其他未被占用的端口号，如9090。

- 保存并重启服务器。

2、端口无效：如果在启动服务器时遇到“The server cannot be started because one or more of the ports are invalid. Open the server editor and correct the invalid ports.”的错误信息，说明配置的端口号无效，同样需要进入服务器编辑器，检查并修正端口设置。

3、防火墙阻止：确保本地防火墙没有阻止Eclipse或Tomcat使用的端口，可以尝试暂时关闭防火墙，或者添加相应的入站规则允许通信通过指定端口。

二、HTTP 404错误

1、资源路径错误：404错误通常表示请求的资源未找到，首先检查JSP文件的路径是否正确，确保文件位于正确的位置，并且URL与文件系统中的实际位置匹配。

2、项目结构问题：确认Web应用程序的结构正确无误，特别是web.xml配置文件中的servlet映射和过滤器设置，如果使用了框架如Spring MVC，还需要检查其配置文件是否正确指向了相关的控制器类和方法。

3、部署问题：有时候即使代码和配置都正确，但由于部署过程中出现了问题也可能导致404错误，尝试清理并重建项目，然后重新部署到服务器上。

三、HTTP 500错误

1、语法错误：JSP页面中的语法错误是导致500内部服务器错误的常见原因之一，仔细检查JSP文件中的每一行代码，尤其是动态脚本部分，确保所有的标签、表达式以及脚本语句都符合JSP规范。

2、依赖缺失或不兼容：确保项目中引用的所有库文件（如Servlet API、JSP API等）已正确添加到构建路径中，并且版本之间相互兼容，缺少必要的jar包或者版本冲突都可能引发运行时异常。

3、数据库连接问题：若应用程序涉及到数据库操作，请核实数据库连接字符串、用户名及密码等信息是否准确无误；同时也要确保目标数据库服务正在运行且可以接受来自客户端的请求。

4、日志分析：查看控制台输出以及IDE提供的调试信息，这些往往能提供关于具体出错位置的重要线索，根据错误栈追踪定位问题根源，并采取相应措施加以解决。

四、其他常见问题及解决方案

1、ClassNotFoundException：当出现此类异常时，意味着JVM未能找到指定的类文件，这通常是因为编译后的class文件尚未生成或是CLASSPATH环境变量设置不当所致，请检查源代码是否已成功编译，并在必要时调整项目的classpath以包含所需的所有目录和jar包。

2、NullPointerException：空指针引用通常发生在试图访问一个未初始化的对象时，为了避免这种情况发生，请确保在使用任何对象之前都已经为其分配了合适的实例，还可以利用IDE提供的自动补全功能来减少手动编码过程中的人为失误。

3、OutOfMemoryError：内存溢出错误表明JVM耗尽了可用的堆空间，这可能是由于程序逻辑不合理造成大量无用对象积累，或者是系统本身的物理内存不足，针对前者，可以通过优化算法设计、增加垃圾回收频率等方式改善；对于后者，则需要考虑升级硬件设施或调整JVM参数来增大最大堆大小限制。

4、FileNotFoundException：文件找不到错误提示指定的文件不存在，请核对路径名是否正确，同时确认该文件确实存在于预期的位置，如果是读取外部资源，还需检查文件权限设置是否允许当前用户进行访问。

5、IOException：输入输出错误涵盖了广泛的I/O操作失败情况，处理这类问题时，应首先排除网络故障的可能性，接着检查相关设备的连接状态是否正常，最后才是对代码本身进行审查，查找潜在的逻辑漏洞或实现缺陷。

在使用Eclipse开发JSP应用的过程中遇到服务器相关问题时，不要慌张，按照上述方法逐步排查即可找到问题所在并加以解决，保持良好的编程习惯，定期备份重要数据也是预防意外情况发生的有效手段之一。